症狀
現象是在 Git GUI 上 (Fork, SourceTree) 對特定檔案 discard 會沒有作用。
如果使用 git reset --hard，就會看見關鍵的錯誤訊息。
Encountered 1 file(s) that should have been pointers, but weren't:
原因1
使用者是有使用 LFS，但是是後來才追加 LFS 規則，導致有些檔案後來才被加入 LFS，但在 Git 上又不是以 LFS 的格式存在，因此持續出錯。
解決辦法
$ git add --renormalize .
$ git commit -m "Fix broken LFS files"原因2
有人修改了檔案大小寫，或系統上甚至有 2 份檔名只有大小寫不一樣的檔案。Git 預設不區分大小寫 (core.ignoreCase=false)，但 Windows 和 MacOS 都會區分大小寫，不要自作聰明想說讓環境規則一致然後把 core.ignoreCase 改成 true，畢竟你可沒辦法保證其他人的 git config 有修改，我自己已經幹過這種蠢事了。
解決辦法
$ git rm --cached AFile.txt
$ git commit -m 'Remove files conflicting in case'
$ git checkout .Note
這段的錯誤成因和解決辦法不是那麼確定。要再確認。